在高真空的條件下，液體混合物沿著加熱板流動并被加熱，根據不同分子量物質的分子平均自由程的不同，它們在汽化表面與凝結表面之間分子平均自由程的大小以及蒸發度也明顯的不同，輕組分分子的分子平均自由程大，而重組分分子的平均自由程小，使得輕組好能達到凝結板上面被冷凝，使其沿凝結板流下，而重組分子因達不到凝結板而沿著加熱板流下，從而將不同物質進行分離。分子蒸餾作為一種物理分離技術，能解決大量常規技術分難于解決的問題，生產過程綠色安全環保，具有廣泛的應用前景。

　　實驗室分子蒸餾設備的優勢：

　　1、時間短—物料在加熱表面停留的時間短，減少受熱分解的機會。

　　2、低沸點—蒸發溫度遠低于物料的沸點，所以進一步減少物質受熱分解的可能。

　　3、物理分離—分可有效的保護被分離物質，適用于高沸點、熱敏性及易氧化物料的分離

　　4、蒸餾溫度低—低于沸點，這是與常規蒸餾本質的區別；

　　5、真空度高—壓強低，可抑制物料氧化受損。

　　6、蒸餾液膜薄—傳熱效率高，均勻

　　7、分離程度高—無沸騰鼓泡現象，可有效的脫溶、脫臭,適用于溶劑萃取后液體的脫溶，有選擇地蒸出目的產物，去除其它雜質。